影片讲述了一群流浪细菌进入人体后的种种和一位普通人因细菌感染从患病到痊愈这两个发生在细菌和人类中的故事，通过这样两个几乎无时无刻不在上演的故事，以小见大，分别从人类和细菌两种微观视角，讲述了在这故事背后人与细菌上千年漫长的共存史和斗争史。影片摒弃了非黑即白的认知观，从科学辩证的角度，阐明了人与细菌之间亦敌亦友的关系，同时对滥用抗生素和超级细菌等问题做了科学的解答，指出了诸如超级细菌等问题恰恰是由于人类自身的行为导致的。

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